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幽門螺桿菌是人類最常見的慢性感染細菌，全球約半數人口感染幽門螺桿菌，70%以上的胃癌與幽門螺桿菌感染有關。中科院青島生物能源與過程研究所、中國疾病預防控制中心傳染病預防控制所（中國疾控中心傳染病所）、青島市立醫院、青島星賽生物等單位研究人員組成的聯合團隊，依托原創的臨床單細胞拉曼藥敏快檢系統（CAST-R），建立了單個細菌細胞精度、“鑒定—藥敏—溯源”全流程一體化的幽門螺桿菌診療技術——CAST-R-HP，具有快速病原鑒定、精確藥敏表型檢測、基于單細胞全基因組支撐耐藥機制研究與精準溯源等優勢。相關研究成果近日發表于《臨床化學》。
目前幽門螺桿菌耐藥菌鑒定的臨床金標準是內鏡檢查與細菌培養相結合的藥敏檢驗。由于其生長條件苛刻，分離和培養胃活檢標本中的幽門螺桿菌通常需7~10天，且難以考察臨床樣品中“原位”的病原多樣性。表型藥敏實驗同樣耗時很長，且技術要求高。而基于基因型的藥敏檢測方法僅能預測部分已知耐藥基因的突變，并存在不同程度的假陰性。目前臨床醫生主要依賴經驗用藥而非藥敏結果指導下的精準治療。但是，隨著幽門螺桿菌耐藥性的不斷增加，經驗治療的根除失敗率日益嚴重。
利用CAST-R-HP，從臨床樣品到藥敏結果的完整診療流程可縮短至3天，而且能在單細胞分辨率、全基因組水平完成耐藥機制研究與精準溯源。
下一步，研究人員將基于“微生物藥敏單細胞技術臨床示范網絡”開發CAST-R-HP系統，拓展其應用，為建立單細胞精度的幽門螺桿菌診療與疾控體系奠定技術和裝備基礎。（廖洋 劉佳）
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